1.2.2　二级结构

蛋白质或肽的线性延伸链段具有不同的、特征性的局部结构构象，称为二级结构，其形成主要依赖于氢键。二级结构的两种主要类型是α-螺旋和β-折叠。

α-螺旋是右旋螺旋。α-螺旋中氨基酸的侧链取代基向外延伸，氢键形成于链中每个CO的氧和螺旋线中其后第四个N—H的氢之间。氢键使这种结构变得特别稳定。氨基酸的侧链取代基位于N—H基团之外。

β-折叠中的氢键是在肽链之间(股间)而不是肽链之内(股内)。折叠构象是由成对并排排列的股线组成的。单链上的羰基氧与相邻链上的氨基氢键合。两股线可以是平行的，也可以是反平行的，这取决于股线方向(N端到C端)是相同还是相反。反平行的β-折叠由于氢键排列较为整齐而更加稳定。